WordPress index.php siliniyor

Merhaba, bir sunucu içerisinde websitem var. Add-on domain olarak 3-4 site daha barındırıyorum. Ana site içerisinde bir sorun yok fakat add-on domain olarak eklediğim sitelerin index.php dosyaları siliniyor içerisine otomatik olarak farklı gereksiz php dosyalar oluşuyor

Ana site > geceizle.net

Gereksiz phplerin bulunduğu örnek klasör
http://geceizle.net/patikonak.com/gls6/

bu örnek klasörün bulunduğu web sitesi normalde patikonak.com. Fakat indexi sildiği için siteye erişilemiyor. Bunun gibi bir kaç site daha mevcut. Farklı farklı dosyalar oluşuyor.
Ayrıca sadece wordpress değil. Prestashop kurulu farklı bir add on domain daha var onda da bu sorun mevcut.

Sorun nedir ? Yardımcı olabilecek bilgisi olan var mı acaba

Not : Umarım konuyu doğru kısma açmışımdır

Merhaba konunuzu postu atmadan önce gördüm fakat öğrenci olduğum için beni zorlayacağını düşünüyorum. Şimdilik daha önce sorunu yaşayan ve çözüme ulaşanlardan yardım istiyorum. İlginize teşekkür ederim