Kendi çabalarımızla çözdük çok şükür.
Arkadaşlar çözümü anlatmak gerekirse bayağı uzun bir yol izledim yinede kısaca bir özet geçmek gerekirse array_replace komutu ile arrayın istediğim herhangi bir indisine istediğim değeri girdim böylece arraya attığım satırların istediğim her hangi bir tanesini değiştirdim fwrite ile tekrar dosyaya yazmayı başardım :)