Anladığım kadarı ile konu farklı yerlere gidiyor.
Google bir sitenin aynı formatta yani ''ayrıca m. mobil. olmadan'' yayında olmasının daha sağlıklı olduğunu söylüyor ve bu yüzden Amp uygulaması var.
İndex hakkında google da yapabileceğiniz bir şey yok maalesef. Önemli olan sinir bozucu olması değil, index almasıdır. Bu ara index konusunda google zaten cimri davranıyor biraz.
Search console da eklediğiniz site haritasında; ilk olarak mobil index ağırlık veriliyor. Bu yüzden sanırım mobil index olarak çıkmış sizde.
E-ticaret sitesinde mobil alternatifi yapmak bence pek mantıklı değil. Amp uygulamasına da gerek yok. Önemli olan sitenin tamamen mobil uyumlu olması ve mobil açılış hızının iyi olmasıdır.