Google "www" kullanıyorsa vardır bir bildiği diyebilirim :D
Yanlış bir bilgi vermek istemiyorum ama sub domain düşünürsek ve google üzerinden örnek vermek gerekirse;
www.google.com
mail.google.com
plus.google.com

diye sitelerin işlevlerine göre ayırmış. E-Postaya mail.google.com vermiş. Google +'ya "plus.google.com" vermiş. "www" bir ana bölüm olabilir belki.

Seo açısından da bir sorun olmayacağını düşünüyorum. Ama başka forumda da birisi www'lü indexim 15 bin, www'süz 769 demiş. Seo etkisi olsaydı. Twitter'da www kullanırdı. Veya tam tersi bir etkisi olsaydı Facebook www'süz kullanırdı ;)