<script></script>
kodunu
<script></script>
kodunun üzerine taşıyın. Eğer sorun çözülmez ise tüm javascript kodlarını
tagının üstüne taşıyın.
Ek olarak sorununuz jquery dosyasının kullanıldığı yerlerden önce değil sonra tanımlanması. Doğal olarak dosyayı bulamadığı için slider vb jquery kullanan elementler çalışmıyor. Lokalde hata olarak gözlemleyemezsiniz genellikle hostingte çalışırken karşılaşılan bir sorundur.