Ssh ile bağlanıp;
nano /usr/local/apache/conf/httpd.conf

ctrl+w tuş kombinasyonunu kullanıp alanadi.com olarak aratıyorsunuz.

sitenizi bulduktan sonra hangi php sürümünü kullanıyorsanız altına

php_admin_flag safe_mode Off

Satırını ekleyip kaydediyorsunuz böyle o site için safe_mode ve open_basedir kapanıyor.