tahminimce önce menüleri düzenlediniz. ve bağlantıları direk url olarak verdiniz. daha sonra kalıcı bağlantıları değiştirip menüleri güncellemediniz. bu olabilir buna bir göz atın bence.
eğer sorun bundan kaynaklı değilse temada da bir sıkıntı olabilir.