yukarıdaki mysqltuner sonucuna göre innodb buffer pool size 5M görünüyordu. Ayrıca join buffer ve sort buffer size değerleri çok büyük gibi geldi bana. Tabi bu rakamlarla performans alıyorsan bilmiyorum. Sosyal paylaşım sitesinin ihtiyaçları farklı olabilir ama alttaki linkte verilen örnek konfigürasyonları inceleyebilirsin.

http://www.gk-root.com/GK-Blog/optimize-mysql-apache-on-cpanelwhm-server/