Tam olarak açıklamamışın bi sistem mi kullanıyosun yoksa kendi veri tabanında mı yani php ve sql kullanarak kolayca değiştire bilirsin

örnek olarak şöyle anlatıyım

bir php sayfası oluşurursun link tablosunu veritabanından çekrsin var döngüye sokarsın

döngünde çektiğin her satırı link stünündaki değeri değişkene alırsın ve
$link = "http://eskidomain.com/konu/index.php";
$yenilink = str_replace("eskisizedomaini.com","yenisitedomaini.com",$link);
dersin sonrada tekrar sql sorgusuyla Update yaparsın bulunduğun satırı ve bunu döngüyle yaptığn için tek seferde bütün linkleri değiştirirsin

Yardımcı oldum mu bilemiyorum ama inşallah olmuşumdur :D