Bence 301 olayını kesin yapın. Webmaster Tool'dan bildirip bildirmemek ise size kalmış.
Eğer link yapısı da değişti ise, domain değişikliği ile teker teker redirect yapabilirsiniz.
Bende sitemi wordpress'e taşıdığımda hem domaini değiştirmiştirdim hemde link yapısını.
Arama motorlarında hala eski içerikler çıkıyordu bende onların yerine yenisi gelene kadar üşenmedim tüm içeriği Redirect yaptım:
http://tumcasino1.com/oyunlar-1-book-of-ra.html tıklayınca
http://tumcasino1.com/slots/book-of-ra/ açılıyor mesela.