Kesinlikle yazılım ile kaynaklı olduğunu düşünüyorum. Sitenize pek göz gezdiremedim ama bunu size daha önce başka bir forumda, bakşa bir sorun için alıntı ile yanıtlamak istiyorum. Tabiki buda benim yorumumdur, sadece c+v felsefesine inanıyorum :) Ama bence sorun Google'da değil, senin web sitende..
Sorun çözüldü hocam ana sayfaya müdahale eden W3 Cache eklentisiymiş. Doğru ayarları yapınca şu an normale döndü.