Merhaba,
Web sitenizin yapısını değiştirirken ilgili sayfaları tek tek 301 yaptınız mı?
Google Web Master Araçlarına yeniden eklediniz mi?
Eskiden olan ama şuan olmayan sayfalarınızı ne yaptınız?
Tasarım ve kodlamanız W3C standartlarına uygun mu?
Sitenizin açılma hızı?
Mobil uyumlumu?
Bunlar temel sebepler olabilir. Detaylı analiz ve inceleme yapmak lazım.
Hayırlı Sabahlar.