Şöyle bir ihtimalde var kategori etiketini kaldırdığınız eklenti yüzünden yoast kategori sayfalarını normal sayfa olarak görüyor olabilir.

Bunun haricinde yoastın içinde kategori etiketini kaldırmak için seçenek mevcut. Gelişmiş > Kalıcı bağlantılar
"Kategorisinde URL'den kategori baz (genellikle /kategori/) ." işaretlerseniz /kategori/ gözükmez. Bence diğer eklentiyi devre dışı bırakın