Herhangi biryere bir dosya atmayacaksınız, php.ini dosyası zaten sunucunuzda mevcuttur. VestaCP de nerede bulunduğunu bilmiyorum. find / -name php.ini komutuyla yerini bulabilirsiniz.

Örneğin dosya boyutu için aşağıdaki değeri değiştirmeniz gerekiyor php.ini dosyasında.