Denemedim ama en basit haliyle aşağıdaki gibi oluyor sanırım. Yalnız, menü ve bileşenler değiştirilen temada çalışmayabilir. Hatta bu kod bile çalışmayabilir :)

functions.php dosyasına
if(wp_is_mobile()): // mobil cihaz kontrolü
switch_theme('tema_klasör_adı'); // tema değiştir
endif;