Mysql gayet hızlıdır. Eğer yaptığınız işlem yüksek trafikte yavaşlıyor ve sunucuyu kitliyorsa bu mysql den değil kodlayandan kaynaklıdır.

Profesyonelce biçimde index atıldığı ve veriler sadece index değerlerden çekildiği müddetçe (abartmadan index atmak lazım) hiç bir şekilde sıkıntı yaratmaz.

Hatta en hızlı sql serverdir.