Robots.txt aracılığı ile engelleyebilirsin.

Örneğin:

User-agent: HTTrack
Disallow: /

User-agent: WebZip
Disallow: /

User-agent: CopyRightCheck
Disallow: /

User-agent: SiteSnagger
Disallow: /

User-agent: ProWebWalker
Disallow: /

Aklıma gelenler bunlar. Dahası varsa aynı metodla engelleyebilirsin