Hocam öncelikle a.com domaini üzerinde mağaza kurmak için bir veritabanı oluşturdunuz bu veritabanı üzerine mağazanızı kurdunuz, aynı şekilde a.com/shop klasörü altında ikinci bir mağaza oluşturarak bir veritabanı daha oluşturup onun kurulum dosyalarını da bu klasöre atmanız durumunda kurulum yapılabilir. Yada aynı işlemi subdomain oluşturarakta gerçekleştirebilirsiniz. Örn; shop.siteadi.com gibi..