2 farklı ayar dosyası yapacaksınız. PDO kullanarak
http://www.erbilen.net/pdo-kullanimi/ burada anlatıldığı gibi farklı bağlantıları farklı değişkenlere atarsanız problem çıkmayacaktır. Ama oldu ki problem çıktı kodları farklı sayfalarda include ederek yani APP mantığını kurarak farklı sayfalarda çalışabilir çakışmaları önleyebilirsiniz.