http://yavuz-selim.com/07/02/2016/157/pdo-excelden-veri-cekme-ve-kaydetme-islemi buyur kardeşim blogumda anlatmıştım buradan rahatlıkla yapabilirsin.

Buradaki konu sayesinde önce exceldeki verileri veritabanına yazdırırsın yazdırdıktan sonra ise

http://yavuz-selim.com/30/12/2015/74/php-excele-veri-yazmak

bu konudaki gibi o veritabanındakini istediğin gibi excele indirirsin :) biraz uzun gelebilir ama içerisinde 10 bin tane veri var ise en azından düzeni bozulmadan saniyesinde birinden birine alabilirsin.