bu bir sorun değil, bence gereksiz bir istek. çünkü böyle yapmanın size hiçbir yararı olmayacak, diğer yönden index.php 301 yönlendirmesinde gözükecek ve buna hiçmi hiç gerek yok. buyrun;

RewriteEngine On

RewriteCond %{REQUEST_URI} index\.php
RewriteRule ^(.*)index\.php$ /$1/ [R=301,L]

yukarıdaki kısmı .htaccess dosyanıza yazmanız yeterli, son olarak yine bunun gereksiz birşey olduğunun altını çiziyorum.