.com .net .org sayfaları index.php sayfasındaki kodları açarlar.

index.php görünmez gibi görünsede diğer sayfalara bağlantı sağlayan bir sayfadır.

normalde arama motorları domain uzantısınıda indexler index.php yide indexler

Peki neden index.php yi indexliyor ?

Çünkü index.php de diğer sayfalara geçiş linkleri bulunmaktadır. Domain uzantısınıda indexlemesinin sebebi sitenin anasayfası olmasıdır.

Yani siteyi sen .com olarak arama motorlarına kayıt ettiğin zaman sitene gönderilen botlar senin sunucunda bulunan dosyaları indexler.

Sunucunda index isimli bir dosya bulundurmazsan siteyi çalıştıramazsın dimi ?

Kısacası indexlenen sayfan senin index.php dir. ve sen arama motoruna domainimi indexle diye gidiyorsun. e buda motor yani geliyor anasayfana bakiyor ordan kodlari aliyor extra olarak sunucundaki dosyaları alıp gidiyor.