Öncelikle çektiğin html dosyalarını parçalaman lazım. (temel olarak : header.php,index.php,footer.php)
zaten parçaladıysan header kısmındaki css'ler çalışmayacaktır çünkü dosya yollarını alamayacaktır.
codex.wordpress.org'u kesinlikle incelemen gerekir.
en basit olarak şu şelilde doğru yolu gösterebilirsin.