Biraz üzerinden zaman geçmiş ancak bazı arkadaşlara yardımcı olma amaçlı yazayım dedim.

http://blog.natro.com/ssh-uzerinden-cpmove-dosyasi-olusturma-ve-yuklenmesi/

Öncelikle şunu buraya koyalım tek hesaplar için..

Diğer toplu yedekleme işlemlerı sırasında backup ayarlarından yola çıkarak yedekleme yapar backup ayarlarını kontrol edip tekrar yedekleme yapması lazım

SSH yedekleme komutları için şu konu yeterli olur sanırım

http://webmaster.bbs.tr/showthread.php/11547-cpanel-sunucularin-ssh-uzerinden-yedek-alim-ve-yedek-yukleme-islemi