Cpanel Remote Upload veya direkt dosya yöneticisinden kendim Cpanel üzerinden gönderiyorum. FTP'ye nazaran kat kat hızlı oluyor.
Her ne kadar ismi duyulmuş sistemler olsa da, bilinmemiş sistemler FTP şifrelerinizi, özel dosyalarınızı (veritabanı şifresi geçen config dosyaları gibi dosyaları) istedikleri gibi kullanabilirler. Keylogger şeklinde düşündüğünüzde, aslında siz bilgilerinizi bile bile yazıyorsunuz. Güven konusunda elbette bu tartışılır.
Ona bakıldığında herhangi bir tarayıcıdan yaptığınız tüm işlemler aynı şekilde o tarayıcıyı yapan grup tarafından izlenilebilir halde olabilir. (Ki çoğu istatistikler -AlexaRank vb.- bu şekillerde elde ediliyor.)
Yani karar size kalmış, ama araya başka bir sistem koymaya gerek yok. Cpanel güvenliği bile tartışılırken, araya farklı programlar koyarak durumu riske atmaya gerek yok. :)