Sorun sunucu türünüzü seçerken farklı bir tür seçtiğinizden kaynaklanıyor. Bizzat başıma geldi ve şu şekilde bir 301 yönlendirmesi ile sorunun önüne geçtim.

RewriteEngine On
RewriteCond %{SERVER_PORT} 80
RewriteRule ^.*$ https://%{SERVER_NAME}%{REQUEST_URI} [R=301,L]

Anasayfa çerezlerden sonra güvenli bir şekilde açılmaya başladı.