Çözüldü :
Uzun aradan sonra cevap yazayım dedim. Hostcum engellememiş. Fakat nasıl olduysa düzeldi sorun. Sitemde PHP sürümü kaynaklı açılmayan sayfalardan dolayı Yandex Webmaster da bir sürü bozuk link gözüküyordu. Sürümü Düzelttikten sonra Yandex Webmaster dan "Check" dedim ve bu şekilde düzeldi sanırsam. Emin olmamakla beraber bir deneyebilirsiniz.