1: Footera session koyulmaz.
2: Headera session koyduysan diğer kısımlara çekmene gerek kalmaz. / tabii, farklı sayfalara başına include'header.php'; çekmeyeceksen ekleyebilirsin. Bu sefer şu sorun çıkar; sql bağlantın iptal olur, session çalışmaz.
3: Eğer Top.php'i index.php'de include ettiysen, header.php'de bulunan session tüm sayfada çalışacaktır. O yüzden sorun etme.


edit: bu yazdıklarım durumdan duruma farklılık gösterebilir.