Chat global mi yoksa private mi ? 2 kişi arasında olacaksa, GET ile idleri alıp WHERE kısmında id leri filtre edip ORDER BY id ASC diyerek ilk olan önce olacak şekilde while ile çekip bastırabilirsiniz.

Ajaxdan gelenleride prepend yaparsanız aşağıya doğru devam eder.

Eğer en son mesaj en üstte olsun istiyorsan ORDER BY id DESC ile while echo yaptırıp, ajaxdan gelenleri append ile en üste yazdırırsın.