Burada işinize yarayacak bazı temel linux komutlarını bulabilirsiniz. https://www.tamindir.com/blog/bilmeniz-gereken-temel-linux-komutlari_20354/
Ayrıca eğer sunucuya FTP ile bağlanabiliyorsanız dosya/dizin işlerinizi FileZilla ile de kolayca yapabilirsiniz.

İyi forumlar.