FFMpeg ile falan yapabilirsin bu video, logo ekleme olayını ama hostingde vs. bu işleri yapamazsın ffmpeg'in c kütüphanesini dahil etmen lazım php çekirdeğine, kaldı ki 3-5 mblık videolar değilse hosting işlem gücüyle yapılacak şey değil, bunu da bil diye söylüyorum.