Yükseltsenizde düşürsenizde her hangi bir veri kaybı olmaz, sadece site eğer limite takılırsa askıya alınır erişim vs. olmaz. Disk limitini küçük verirseniz veritabanı işlemi yapamaz hatta phpmyadmine bile bağlanmakta sorun yaşarsınız, yine bu durumdada veri kaybı olmaz disk limitini arttırdığınızda normale döner.