Otomatik güncellemeden kastınız nedir?
Hali hazırda tetiklenen cronlar ne gibi işlemler yapıyorlar, görevleri neler? (Anlık oluşturabileceği yük ile alakalı bilgi edinmeye çalışıyorum.)
Sunucuyu yeniden başlattığınızda sıkıntı ortadan kalkıyorsa ve bu otomatik işler aynı anda değilde farklı zamanlarda çalıştırıldığında CPU sıkışmıyorsa işler kuyruklandırılmalı. O zaman problem ortadan kalkacaktır.