Plesk Paneli tam hatırlamıyorum fakat onunda cpanel gibi yedek alıyor olması gerek. Panelin aldığ yedek Ftp+SQL dosyası şeklindedir. Bence ikisi içinde pek bir fark olmuyor ama benim tavsiyem Ftp+SQL şeklinde kendin alman nolur nolmaz diye :)

Ben yedekleme olarak dropbox ve pcloud kullanıyorum.