Öncelikle iki tabloyu da seçeceksin sonra verileri arraya aktaracaksın. Arrayı for each döngüsüne sokacak geri kalan kontrolü if ile yapıp update edeceksin.

Yararlı olabilecek kaynaklar:
https://www.erbilen.net/pdo-kullanimi/
https://secure.php.net/manual/tr/control-structures.foreach.php
https://secure.php.net/manual/tr/control-structures.if.php