Bu yazılıma bağlı olmakla birlikte benim tavsiyem PDO kullanımıdır. Hem daha güzel bir yapısı hemde bir çok veri tabanını desteklemesi nedeni ile daha avantajlıdır ayrıca daha hızlı iletişim kurduğu söylenmekte. Böylece yazdığınız yazılım sadece MYSQL'e bağımlı kalmaz farklı veri tabanı sistemleriyle de çalışabilir ve elinizde ileriye dönük bir sistem olur.
Fakat tercih tamamen sizde kalmıştır. Eğer sadece MYSQL veri tabanlarıyla çalışcak bir sisteme ihtiyacınız varsa onu kullanabilirsiniz ama PDO kullanırsanızda fazladan özellikler kazanmış ve kazandırmış olursunuz.