hocam önce iyi düzenlenmiş bir sitemap oluşturun.
bunu search console'dan dizine ekleyin.
1-2 bekledikten sonra aynı yerden, kaç tane url'in dizine eklendiğini bakın.
eklenmeyen url'ler için manuel inceleme talep edin.
3-4 gün içinde hepsi eklenmiş olacaktır.

Search Console'un yeni sürünümü kullanmanı tavsiye ederim.