RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . index.php [QSA]
Diğer ihtimal sorun başka yerden de kaynaklı olabilir. Maalesef detaylı bir inceleme yapabilecek zamanım yok. İsterseniz yazdığınız sistemin bir kısmını bana pm ile yollayın zaman bulunca inceleyeyim.