Öncelikle forumda bu konu hakkında bilgi sahibi olan var mıdır bilmiyorum. Senin için bir bağlantı buldum.
http://www.brainboxes.com/faq/items/how-do-i-control-a-serial-port-using-php
Burada PHP Direct IO eklentisinin kurulumu ve php ayarlamaları anlatılmış. Bi incele istersen.