Kullandığınız hostunuzun güncel anti-virüs ya da malware tarama hizmeti olmalı.
Öncelikle sitenin komple yedeğini al,
notepad++ kur,
Ara sekmesi altında Dosyalarda Bul seçeneği var (Ctrl+Shift+F)
Aranan kısmına base64 yaz, değiştir kısmı boş olsun, Dizin kısmından sitenin komple yedeğinin olduğu klasörü bul ve tarama yaptır.

Arama sonrasında kodun hangi sayfada olduğunu göreceksin bu şekilde tema ya da plugin de mi olduğunu anlayabilirsin.