Bağımlılık hatası vermiş "roundcubemail conflicts" ile "cpanel-roundcubemail-1.3.6-1.cp1176.noarch " birbirleri ile çakışmış.
Bakın burada "RPM conflicts" başlığı altında aynı hatanın mysql olanı verilmiş.
https://documentation.cpanel.net/display/CKB/RPM+Installation+Failures#8153c4e8c5c74e5e93b9c505eefcf9cf
Troubleshoot tab sekmesi altında da nasıl çözüldüğü açıklanmış.