Site haritanız index sayınızı doğrudan etkilemez. Yani hiç site haritanız olmasa bile index almaya devam edersiniz. Site haritası sadece tüm sayfa ve bağlantıları tek bir liste halinde sunan bir belge. Yaptığınız bu değişikliğin doğrudan index sayınızı engellediğini düşünmüyorum. Bence sorunu başka bir yerde arayın.