Sitemap dosyalarının ismi değişebilir (tekrar gönderirsiniz)
Robots.txt düzenlemesi yaparsınız.
Meta descriptionlarınızı kaybedebilirsiniz. Tekrar eklersiniz manuel olarak.
Yaptığınız özel ayarları (İndex,noindex vs. Onları kaybedersiniz.)

Yani yaptığınız ayarları not Edip, yeni eklentide aynı ayarları yapıp gerekli güncellemeleri yaparsanız (sitemap, robots.txt vs.) Bir problem olmaz.

Ama kişisel tercihim yoast seodur. Daha güzel, daha basit, tam olması gerektiği gibi. Eksiği yok, fazlasıda yok.

Bu hatanın sebebi genelde başka eklentilerle çalışmasından yada yoast JavaScript dosyalarının eksikliğinden kaynaklanır. Bazı hostinglerde wp panelden yaptığınız güncellemelerde bazı dosyalar download edilmiyor.

Yoast SEO dosyalarını indirin ve ftpden gerekli kısımlara üstüne yazdırarak atın.

Halen düzelmezse F12 den konsol bölümüne gelin ve verdiği errorlari buraya resim olarak atın bakalım hocam.