Olunca css şöyle olur:
body.dark .container {
background-color: #000;
color: #fff;
}
Jquery ile butona tıklayınca body'ye dark class'ı verirsin veya dark varsa silersin.
$('.dark-mode').on('click', function() {
$('body').toggleClass('dark');
});
Yalnız, sayfa yenilenince dark modun aktif olması için, jquery ile cookie oluşturmalısın. Yani cookie de dark: true gibi bir şey. Sonra php ile, cookie yi kontrol edip, body'yi dark class'ı ile açmalısınki, kullanıcılar her seferinde dark moda basmak zorunda kalmasın.
Cookie olayı biraz ayrıntıya giriyor. O kadar vaktim yok anlatmaya. Biraz uğraşırsanız ve kodlarınızı yazarsanız yardımcı olurum yine.