if (!empty($user)) {
$data = array(
'kurum_onay' => 1,

);
Tek verili dizilerde virgül kullanılmaz. Model php de 1 in yanınki virgülü silip deneyin.
if (!empty($user)) {
$data = array(
'kurum_onay' => 1
);
Mobilim düzgün yazamadım pek ama anlaşılmıştır umarım.