Cpanel kullanıyorsanız ve addons domain ile yeni domaini eklediyseniz site klasörünün public_html klasörü içerisinde olması gerekiyor.
Yanlışlıkla taşımış olabileceğinizi düşünüyorsanız son değişiklik tarihine bakarak ilerleyin.
Eğer hiç bir iz yoksa belkide öyle bir klasör hiç olmamıştır.