Tema veya Eklenti içinde class.plugin-modules.php/class.theme-modules.php(Bu dosyaların içinde shell ile birlikte reklam virüsü saklıdır -Silmeden önce içine bir bakınız) gibi bir dosya olması lazım direkt sil gitsin denedim daha önce sıkıntısız bir şekilde çalışıyor

//Bir virüs programı ile taratınız dosyaları
//Shell detector ile sunucuyu kontrol edebilirsiniz

Site yeniyse sıfırla sunucuyu sonra trojen kısımları temizleyip tekrar kurmanı öneririm