Subdomain bambaşka bir site demek. Ana siteyle hiç alakası yoktur. Sıfırdan seo vs. yapılması gerek. Ama kullanımı daha kolay oluyor. Yönetimi de daha rahat. Alt klasör olarak yaptiginizda ise ana domainin seo'sundan beslenir. Farklı bir site sayılmaz.