Sunucu olarak ne kullanıyorsunuz ? NodeJS dosyaları LAMP, WAMP vb sistemler üzerinde değil NodeJS ile çalışırlar. Yani PHP dosyası gibi get/post vb methodlar ile JS dosyasına parametre gönderip çalıştıramazsınız veya html sayfa içerisine yazdığınız JS dosyası gibi çalışmazlar. İkisi çok farklı sistemler.