Sunucu yönetim panelinden centos 7'yi tekrar kurun. Ya da

yum reinstall paketismi

şeklinde kurduğunuz paketleri kaldırabilirsiniz. Lamp kurmaktaki amaç ne? Lamp kuracaksanız neden plesk kuruyorsunuz? Bence siz lamp kurmayın direk plesk kurun.